Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa1P11477 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa1P11477 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa1P11477 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa1P11477 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa1P11477 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa1P11477 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa1P11477 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa1P11477 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa1P11477 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa1P11477 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms