Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolP11369 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PolP11369 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolP11369 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolP11369 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolP11369 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PolP11369 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolP11369 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolP11369 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PolP11369 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolP11369 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolP11369 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PolP11369 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PolP11369 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PolP11369 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PolP11369 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PolP11369 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PolP11369 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PolP11369 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolP11369 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolP11369 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolP11369 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolP11369 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolP11369 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolP11369 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolP11369 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolP11369 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolP11369 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PolP11369 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolP11369 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolP11369 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolP11369 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PolP11369 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolP11369 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolP11369 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PolP11369 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolP11369 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolP11369 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PolP11369 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolP11369 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PolP11369 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolP11369 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolP11369 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolP11369 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolP11369 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolP11369 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PolP11369 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PolP11369 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PolP11369 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PolP11369 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PolP11369 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PolP11369 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PolP11369 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PolP11369 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PolP11369 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PolP11369 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PolP11369 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PolP11369 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PolP11369 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PolP11369 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PolP11369 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PolP11369 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PolP11369 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PolP11369 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PolP11369 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PolP11369 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PolP11369 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PolP11369 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PolP11369 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PolP11369 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PolP11369 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PolP11369 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolP11369 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolP11369 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolP11369 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolP11369 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PolP11369 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolP11369 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolP11369 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolP11369 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolP11369 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolP11369 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolP11369 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolP11369 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolP11369 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolP11369 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolP11369 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolP11369 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolP11369 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolP11369 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolP11369 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PolP11369 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PolP11369 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PolP11369 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PolP11369 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PolP11369 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PolP11369 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PolP11369 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PolP11369 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PolP11369 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms