Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc6P10629 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxc6P10629 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc6P10629 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxc6P10629 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxc6P10629 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms