Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UbbP0CG49 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
UbbP0CG49 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UbbP0CG49 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UbbP0CG49 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UbbP0CG49 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UbbP0CG49 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UbbP0CG49 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UbbP0CG49 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UbbP0CG49 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UbbP0CG49 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UbbP0CG49 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UbbP0CG49 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UbbP0CG49 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UbbP0CG49 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UbbP0CG49 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UbbP0CG49 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UbbP0CG49 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UbbP0CG49 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UbbP0CG49 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UbbP0CG49 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms