Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Surf1P09925 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Surf1P09925 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Surf1P09925 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Surf1P09925 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Surf1P09925 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Surf1P09925 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Surf1P09925 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Surf1P09925 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Surf1P09925 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Surf1P09925 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Surf1P09925 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms