Protein–RNA interactions for Protein: P09803

Cdh1, Cadherin-1, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh1P09803 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh1P09803 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh1P09803 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdh1P09803 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms