Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxb3P09026 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb3P09026 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb3P09026 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms