Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp1P08042 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp1P08042 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp1P08042 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp1P08042 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms