Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna4P07351 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifna4P07351 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna4P07351 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms