Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ifna5P07349 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifna5P07349 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms