Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtrP07309 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtrP07309 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtrP07309 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtrP07309 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtrP07309 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TtrP07309 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtrP07309 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtrP07309 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtrP07309 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtrP07309 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtrP07309 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtrP07309 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtrP07309 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TtrP07309 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtrP07309 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtrP07309 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtrP07309 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtrP07309 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtrP07309 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtrP07309 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtrP07309 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtrP07309 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtrP07309 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtrP07309 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtrP07309 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtrP07309 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtrP07309 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TtrP07309 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtrP07309 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtrP07309 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtrP07309 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtrP07309 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtrP07309 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtrP07309 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtrP07309 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtrP07309 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtrP07309 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TtrP07309 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TtrP07309 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TtrP07309 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TtrP07309 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TtrP07309 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtrP07309 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtrP07309 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtrP07309 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtrP07309 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtrP07309 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtrP07309 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtrP07309 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtrP07309 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtrP07309 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtrP07309 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtrP07309 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtrP07309 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtrP07309 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtrP07309 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TtrP07309 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtrP07309 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TtrP07309 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtrP07309 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtrP07309 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtrP07309 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtrP07309 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtrP07309 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtrP07309 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TtrP07309 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtrP07309 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtrP07309 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtrP07309 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtrP07309 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtrP07309 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtrP07309 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtrP07309 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtrP07309 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtrP07309 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtrP07309 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtrP07309 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TtrP07309 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtrP07309 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtrP07309 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtrP07309 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TtrP07309 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtrP07309 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtrP07309 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtrP07309 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtrP07309 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtrP07309 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtrP07309 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtrP07309 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TtrP07309 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtrP07309 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtrP07309 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtrP07309 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtrP07309 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtrP07309 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TtrP07309 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtrP07309 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtrP07309 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtrP07309 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms