Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gap43P06837 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gap43P06837 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gap43P06837 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gap43P06837 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gap43P06837 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gap43P06837 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gap43P06837 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gap43P06837 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gap43P06837 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gap43P06837 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gap43P06837 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gap43P06837 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms