Protein–RNA interactions for Protein: P06795

Abcb1b, Multidrug resistance protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1bP06795 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcb1bP06795 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcb1bP06795 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb1bP06795 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms