Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apoa4P06728 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa4P06728 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apoa4P06728 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms