Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdgfrbP05622 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfrbP05622 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PdgfrbP05622 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PdgfrbP05622 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms