Protein–RNA interactions for Protein: P05143

Prp2, Proline-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prp2P05143 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prp2P05143 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prp2P05143 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prp2P05143 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prp2P05143 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prp2P05143 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prp2P05143 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prp2P05143 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prp2P05143 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prp2P05143 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prp2P05143 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prp2P05143 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prp2P05143 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms