Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tk1P04184 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tk1P04184 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tk1P04184 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tk1P04184 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tk1P04184 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tk1P04184 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tk1P04184 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tk1P04184 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tk1P04184 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tk1P04184 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tk1P04184 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk1P04184 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tk1P04184 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tk1P04184 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tk1P04184 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms