Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-Ab1P01921 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms