Protein–RNA interactions for Protein: P01896

H-2 class I histocompatibility antigen, alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01896 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01896 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01896 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01896 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01896 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01896 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01896 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01896 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01896 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01896 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01896 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01896 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01896 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01896 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01896 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01896 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01896 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01896 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01896 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01896 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01896 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
P01896 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01896 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01896 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01896 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01896 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01896 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01896 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01896 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01896 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01896 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01896 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01896 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01896 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01896 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01896 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01896 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01896 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01896 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01896 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01896 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01896 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01896 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01896 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01896 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01896 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
P01896 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01896 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01896 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01896 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01896 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01896 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01896 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01896 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01896 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01896 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01896 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01896 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01896 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01896 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01896 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01896 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01896 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01896 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01896 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01896 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01896 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01896 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01896 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01896 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01896 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01896 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01896 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01896 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01896 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01896 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01896 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01896 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01896 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01896 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01896 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01896 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01896 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01896 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01896 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01896 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01896 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01896 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01896 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01896 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01896 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01896 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01896 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01896 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01896 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01896 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01896 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01896 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01896 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01896 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms