Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01878 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01878 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01878 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01878 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01878 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01878 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01878 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
P01878 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01878 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01878 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01878 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01878 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01878 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01878 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01878 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01878 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
P01878 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01878 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01878 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01878 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01878 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01878 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01878 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01878 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01878 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01878 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
P01878 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01878 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01878 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01878 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01878 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01878 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01878 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01878 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01878 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01878 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
P01878 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01878 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01878 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01878 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01878 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01878 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01878 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01878 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01878 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01878 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01878 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01878 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
P01878 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01878 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01878 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01878 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01878 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01878 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
P01878 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01878 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01878 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01878 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
P01878 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01878 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01878 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01878 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01878 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01878 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01878 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01878 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01878 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01878 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01878 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01878 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01878 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01878 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01878 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01878 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01878 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01878 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01878 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01878 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01878 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01878 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
P01878 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01878 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01878 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01878 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01878 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01878 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01878 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01878 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01878 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01878 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01878 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01878 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01878 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01878 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01878 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01878 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01878 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01878 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01878 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms