Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01791 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01791 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01791 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01791 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01791 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01791 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01791 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01791 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01791 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01791 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01791 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01791 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01791 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01791 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01791 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01791 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01791 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01791 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01791 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01791 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01791 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01791 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01791 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01791 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01791 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01791 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01791 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01791 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01791 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01791 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01791 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01791 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01791 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01791 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01791 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01791 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01791 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01791 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01791 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01791 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01791 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01791 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01791 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01791 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01791 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01791 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01791 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01791 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01791 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01791 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01791 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01791 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01791 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01791 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01791 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01791 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01791 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01791 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01791 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01791 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01791 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01791 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01791 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01791 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01791 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01791 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01791 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01791 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01791 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01791 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01791 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01791 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01791 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01791 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01791 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01791 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01791 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01791 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01791 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01791 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01791 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01791 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01791 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01791 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01791 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01791 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01791 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01791 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01791 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01791 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01791 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01791 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01791 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01791 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01791 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01791 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01791 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01791 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01791 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms