Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccl20O89093 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccl20O89093 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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