Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pak1O88643 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pak1O88643 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pak1O88643 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pak1O88643 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pak1O88643 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pak1O88643 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pak1O88643 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pak1O88643 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pak1O88643 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pak1O88643 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pak1O88643 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pak1O88643 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pak1O88643 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pak1O88643 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pak1O88643 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pak1O88643 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pak1O88643 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pak1O88643 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pak1O88643 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pak1O88643 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pak1O88643 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pak1O88643 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pak1O88643 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pak1O88643 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pak1O88643 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pak1O88643 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pak1O88643 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pak1O88643 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pak1O88643 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pak1O88643 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pak1O88643 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pak1O88643 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pak1O88643 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pak1O88643 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pak1O88643 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pak1O88643 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms