Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23,62■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23,59■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23,59■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23,59■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23,59■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Dync1i1O88485 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23,57■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,55■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23,55■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23,52■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Dync1i1O88485 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23,49■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23,45■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Dync1i1O88485 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,6 ms