Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtssO70370 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtssO70370 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtssO70370 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtssO70370 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtssO70370 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtssO70370 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtssO70370 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CtssO70370 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtssO70370 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtssO70370 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtssO70370 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtssO70370 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtssO70370 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtssO70370 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtssO70370 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtssO70370 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CtssO70370 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtssO70370 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtssO70370 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CtssO70370 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtssO70370 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtssO70370 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtssO70370 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtssO70370 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtssO70370 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtssO70370 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtssO70370 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtssO70370 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtssO70370 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtssO70370 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtssO70370 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtssO70370 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtssO70370 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtssO70370 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtssO70370 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtssO70370 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtssO70370 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtssO70370 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtssO70370 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtssO70370 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtssO70370 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CtssO70370 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtssO70370 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtssO70370 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtssO70370 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtssO70370 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtssO70370 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtssO70370 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtssO70370 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtssO70370 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtssO70370 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CtssO70370 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtssO70370 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtssO70370 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtssO70370 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtssO70370 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtssO70370 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtssO70370 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CtssO70370 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtssO70370 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtssO70370 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtssO70370 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtssO70370 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtssO70370 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtssO70370 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtssO70370 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtssO70370 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtssO70370 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtssO70370 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtssO70370 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CtssO70370 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtssO70370 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtssO70370 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtssO70370 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtssO70370 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtssO70370 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtssO70370 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtssO70370 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtssO70370 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtssO70370 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtssO70370 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtssO70370 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtssO70370 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtssO70370 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtssO70370 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtssO70370 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtssO70370 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtssO70370 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtssO70370 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtssO70370 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtssO70370 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtssO70370 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtssO70370 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtssO70370 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtssO70370 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtssO70370 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtssO70370 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtssO70370 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtssO70370 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.5 ms