Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfi1bO70237 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfi1bO70237 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1bO70237 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1bO70237 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1bO70237 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1bO70237 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1bO70237 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1bO70237 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1bO70237 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1bO70237 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1bO70237 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1bO70237 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1bO70237 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1bO70237 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1bO70237 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1bO70237 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfi1bO70237 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gfi1bO70237 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gfi1bO70237 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1bO70237 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms