Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AurkbO70126 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AurkbO70126 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AurkbO70126 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AurkbO70126 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AurkbO70126 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AurkbO70126 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AurkbO70126 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AurkbO70126 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AurkbO70126 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AurkbO70126 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AurkbO70126 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AurkbO70126 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AurkbO70126 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AurkbO70126 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AurkbO70126 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AurkbO70126 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AurkbO70126 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AurkbO70126 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AurkbO70126 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AurkbO70126 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AurkbO70126 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AurkbO70126 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms