Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HcrtO55241 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HcrtO55241 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HcrtO55241 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HcrtO55241 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HcrtO55241 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HcrtO55241 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HcrtO55241 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HcrtO55241 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HcrtO55241 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HcrtO55241 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HcrtO55241 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HcrtO55241 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HcrtO55241 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms