Protein–RNA interactions for Protein: O55233

Cer1, Cerberus, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cer1O55233 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cer1O55233 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cer1O55233 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cer1O55233 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cer1O55233 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cer1O55233 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cer1O55233 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cer1O55233 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cer1O55233 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cer1O55233 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cer1O55233 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cer1O55233 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cer1O55233 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cer1O55233 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.3 ms