Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChadO55226 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChadO55226 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChadO55226 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChadO55226 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChadO55226 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChadO55226 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChadO55226 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChadO55226 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChadO55226 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChadO55226 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChadO55226 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChadO55226 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChadO55226 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChadO55226 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChadO55226 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChadO55226 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChadO55226 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChadO55226 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChadO55226 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ChadO55226 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChadO55226 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChadO55226 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ChadO55226 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChadO55226 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChadO55226 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ChadO55226 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChadO55226 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChadO55226 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChadO55226 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChadO55226 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChadO55226 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChadO55226 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChadO55226 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChadO55226 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChadO55226 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChadO55226 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChadO55226 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChadO55226 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChadO55226 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChadO55226 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChadO55226 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChadO55226 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChadO55226 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ChadO55226 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChadO55226 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChadO55226 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChadO55226 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChadO55226 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChadO55226 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChadO55226 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChadO55226 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChadO55226 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChadO55226 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ChadO55226 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChadO55226 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChadO55226 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChadO55226 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChadO55226 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChadO55226 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChadO55226 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChadO55226 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChadO55226 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChadO55226 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChadO55226 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChadO55226 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChadO55226 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChadO55226 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChadO55226 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChadO55226 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChadO55226 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChadO55226 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChadO55226 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChadO55226 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChadO55226 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChadO55226 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChadO55226 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChadO55226 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChadO55226 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChadO55226 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChadO55226 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChadO55226 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChadO55226 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChadO55226 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChadO55226 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChadO55226 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChadO55226 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ChadO55226 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChadO55226 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChadO55226 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChadO55226 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChadO55226 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChadO55226 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChadO55226 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChadO55226 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChadO55226 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ChadO55226 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ChadO55226 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChadO55226 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChadO55226 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms