Protein–RNA interactions for Protein: O55137

Acot1, Acyl-coenzyme A thioesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acot1O55137 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Acot1O55137 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Acot1O55137 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Acot1O55137 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Acot1O55137 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acot1O55137 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acot1O55137 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acot1O55137 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acot1O55137 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acot1O55137 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acot1O55137 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acot1O55137 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acot1O55137 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Acot1O55137 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Acot1O55137 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Acot1O55137 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Acot1O55137 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acot1O55137 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acot1O55137 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Acot1O55137 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Acot1O55137 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Acot1O55137 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Acot1O55137 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Acot1O55137 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Acot1O55137 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Acot1O55137 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Acot1O55137 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms