Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prom1O54990 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prom1O54990 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prom1O54990 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prom1O54990 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prom1O54990 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prom1O54990 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prom1O54990 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prom1O54990 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prom1O54990 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prom1O54990 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prom1O54990 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms