Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SlkO54988 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SlkO54988 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SlkO54988 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SlkO54988 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SlkO54988 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SlkO54988 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SlkO54988 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SlkO54988 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SlkO54988 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SlkO54988 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SlkO54988 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SlkO54988 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SlkO54988 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SlkO54988 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SlkO54988 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SlkO54988 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SlkO54988 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SlkO54988 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SlkO54988 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SlkO54988 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SlkO54988 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SlkO54988 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SlkO54988 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SlkO54988 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SlkO54988 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SlkO54988 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SlkO54988 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SlkO54988 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SlkO54988 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SlkO54988 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SlkO54988 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SlkO54988 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SlkO54988 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SlkO54988 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SlkO54988 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SlkO54988 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SlkO54988 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SlkO54988 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SlkO54988 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SlkO54988 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SlkO54988 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SlkO54988 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SlkO54988 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SlkO54988 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SlkO54988 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SlkO54988 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SlkO54988 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SlkO54988 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SlkO54988 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SlkO54988 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SlkO54988 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SlkO54988 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SlkO54988 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SlkO54988 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SlkO54988 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SlkO54988 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SlkO54988 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SlkO54988 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SlkO54988 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SlkO54988 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SlkO54988 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SlkO54988 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SlkO54988 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SlkO54988 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SlkO54988 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SlkO54988 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SlkO54988 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SlkO54988 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SlkO54988 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SlkO54988 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SlkO54988 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SlkO54988 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SlkO54988 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SlkO54988 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SlkO54988 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SlkO54988 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SlkO54988 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SlkO54988 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SlkO54988 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SlkO54988 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SlkO54988 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SlkO54988 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SlkO54988 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SlkO54988 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SlkO54988 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SlkO54988 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SlkO54988 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SlkO54988 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SlkO54988 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SlkO54988 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SlkO54988 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SlkO54988 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SlkO54988 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SlkO54988 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SlkO54988 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SlkO54988 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SlkO54988 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SlkO54988 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SlkO54988 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms