Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tnk2O54967 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnk2O54967 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnk2O54967 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms