Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f6O54917 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f6O54917 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f6O54917 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2f6O54917 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2f6O54917 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f6O54917 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2f6O54917 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2f6O54917 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2f6O54917 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2f6O54917 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2f6O54917 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2f6O54917 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2f6O54917 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E2f6O54917 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f6O54917 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f6O54917 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms