Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf12O54907 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf12O54907 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf12O54907 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms