Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgals6O54891 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgals6O54891 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lgals6O54891 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgals6O54891 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgals6O54891 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgals6O54891 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgals6O54891 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgals6O54891 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgals6O54891 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgals6O54891 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgals6O54891 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgals6O54891 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgals6O54891 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lgals6O54891 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgals6O54891 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lgals6O54891 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms