Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EdaO54693 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EdaO54693 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EdaO54693 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EdaO54693 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EdaO54693 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EdaO54693 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EdaO54693 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EdaO54693 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EdaO54693 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EdaO54693 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EdaO54693 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EdaO54693 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EdaO54693 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EdaO54693 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EdaO54693 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EdaO54693 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EdaO54693 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EdaO54693 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EdaO54693 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EdaO54693 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EdaO54693 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EdaO54693 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EdaO54693 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EdaO54693 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EdaO54693 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EdaO54693 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EdaO54693 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EdaO54693 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EdaO54693 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EdaO54693 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EdaO54693 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EdaO54693 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EdaO54693 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EdaO54693 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EdaO54693 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EdaO54693 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EdaO54693 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EdaO54693 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EdaO54693 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EdaO54693 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EdaO54693 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EdaO54693 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EdaO54693 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EdaO54693 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EdaO54693 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EdaO54693 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EdaO54693 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EdaO54693 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EdaO54693 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EdaO54693 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EdaO54693 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EdaO54693 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EdaO54693 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EdaO54693 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EdaO54693 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EdaO54693 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EdaO54693 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EdaO54693 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EdaO54693 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EdaO54693 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EdaO54693 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EdaO54693 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EdaO54693 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EdaO54693 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EdaO54693 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EdaO54693 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EdaO54693 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EdaO54693 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EdaO54693 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EdaO54693 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EdaO54693 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EdaO54693 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EdaO54693 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EdaO54693 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EdaO54693 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EdaO54693 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EdaO54693 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EdaO54693 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EdaO54693 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EdaO54693 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EdaO54693 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EdaO54693 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EdaO54693 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EdaO54693 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EdaO54693 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EdaO54693 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EdaO54693 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EdaO54693 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EdaO54693 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EdaO54693 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EdaO54693 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EdaO54693 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EdaO54693 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EdaO54693 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EdaO54693 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EdaO54693 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EdaO54693 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EdaO54693 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EdaO54693 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms