Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd2O35927 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd2O35927 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd2O35927 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd2O35927 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd2O35927 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd2O35927 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd2O35927 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd2O35927 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd2O35927 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd2O35927 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd2O35927 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnd2O35927 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnd2O35927 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnd2O35927 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnd2O35927 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnd2O35927 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnd2O35927 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctnnd2O35927 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnd2O35927 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms