Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3cdO35904 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3cdO35904 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3cdO35904 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3cdO35904 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3cdO35904 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3cdO35904 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3cdO35904 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3cdO35904 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3cdO35904 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3cdO35904 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3cdO35904 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3cdO35904 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3cdO35904 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3cdO35904 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3cdO35904 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3cdO35904 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms