Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf12O35738 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf12O35738 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf12O35738 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf12O35738 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf12O35738 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf12O35738 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf12O35738 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf12O35738 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf12O35738 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf12O35738 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf12O35738 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf12O35738 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf12O35738 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf12O35738 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf12O35738 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf12O35738 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms