Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stag2O35638 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stag2O35638 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Stag2O35638 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stag2O35638 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stag2O35638 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stag2O35638 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stag2O35638 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stag2O35638 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stag2O35638 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stag2O35638 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stag2O35638 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms