Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Opn1mwO35599 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Opn1mwO35599 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Opn1mwO35599 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Opn1mwO35599 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Opn1mwO35599 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Opn1mwO35599 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Opn1mwO35599 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Opn1mwO35599 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Opn1mwO35599 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Opn1mwO35599 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms