Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TnxbO35452 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TnxbO35452 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TnxbO35452 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TnxbO35452 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TnxbO35452 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnxbO35452 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TnxbO35452 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TnxbO35452 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnxbO35452 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TnxbO35452 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnxbO35452 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnxbO35452 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnxbO35452 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TnxbO35452 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms