Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CrcpO35427 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CrcpO35427 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CrcpO35427 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CrcpO35427 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CrcpO35427 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CrcpO35427 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CrcpO35427 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CrcpO35427 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CrcpO35427 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CrcpO35427 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CrcpO35427 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CrcpO35427 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CrcpO35427 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CrcpO35427 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms