Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna4O35343 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kpna4O35343 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kpna4O35343 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kpna4O35343 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kpna4O35343 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kpna4O35343 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kpna4O35343 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kpna4O35343 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kpna4O35343 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna4O35343 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna4O35343 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna4O35343 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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