Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf11aO35305 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf11aO35305 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf11aO35305 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.4 ms