Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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Ptpn9O35239 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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Ptpn9O35239 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn9O35239 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
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Ptpn9O35239 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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Ptpn9O35239 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn9O35239 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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