Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Scarb2O35114 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms