Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ArxO35085 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ArxO35085 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ArxO35085 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ArxO35085 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ArxO35085 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ArxO35085 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ArxO35085 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ArxO35085 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ArxO35085 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ArxO35085 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ArxO35085 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ArxO35085 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ArxO35085 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ArxO35085 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ArxO35085 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ArxO35085 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ArxO35085 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ArxO35085 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ArxO35085 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ArxO35085 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ArxO35085 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ArxO35085 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ArxO35085 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ArxO35085 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ArxO35085 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ArxO35085 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
ArxO35085 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ArxO35085 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ArxO35085 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ArxO35085 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ArxO35085 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ArxO35085 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ArxO35085 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ArxO35085 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ArxO35085 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ArxO35085 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ArxO35085 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ArxO35085 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ArxO35085 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ArxO35085 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ArxO35085 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ArxO35085 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ArxO35085 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ArxO35085 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ArxO35085 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ArxO35085 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ArxO35085 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ArxO35085 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ArxO35085 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ArxO35085 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ArxO35085 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ArxO35085 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ArxO35085 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ArxO35085 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ArxO35085 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ArxO35085 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ArxO35085 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ArxO35085 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ArxO35085 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ArxO35085 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ArxO35085 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ArxO35085 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ArxO35085 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ArxO35085 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ArxO35085 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ArxO35085 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ArxO35085 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ArxO35085 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ArxO35085 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ArxO35085 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ArxO35085 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ArxO35085 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ArxO35085 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ArxO35085 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ArxO35085 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ArxO35085 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ArxO35085 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ArxO35085 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ArxO35085 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ArxO35085 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ArxO35085 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ArxO35085 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ArxO35085 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ArxO35085 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ArxO35085 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ArxO35085 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ArxO35085 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ArxO35085 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ArxO35085 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ArxO35085 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ArxO35085 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ArxO35085 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ArxO35085 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ArxO35085 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ArxO35085 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ArxO35085 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ArxO35085 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ArxO35085 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ArxO35085 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms